測試調用測試設計Survival生存曲線繪制軟件環境微生物多樣性軟件轉錄組分析軟件轉錄組軟件購買重測序軟件環境微生物多樣性軟件(1)桌面軟件中藥空間代謝組學檢測中藥非靶代謝組檢測中藥活性成分鑒定中藥入血/入靶成分分析中藥組學ATAC-seqCHIP-seqHi-C測序基因調控OmicsBeanMicrobe Trakr(微生物基因組鑒定分析工具)網頁分析系統WEB分析系統澳洲血清 BovineBD科研管KAPAQIAGENThermoFisherMVE液氮罐4titude? 樣品管標記系統Hi-C建庫試劑盒及基因組組裝軟件無血清細胞凍存液Cell Freezing Medium納米流式檢測儀lexogen支原體檢測試劑盒儀器試劑耗材數據庫開發數據中心TCGA生存數據包功能醫學報告系統開發PlantArray植物生理組平臺特色服務單細胞測序空間轉錄組測序空間代謝組DSP空間蛋白質組FFPE石蠟包埋組織單細胞轉錄組解決方案:10×Flex空間多組學類器官葉綠體、線粒體基因組測序染色體級別基因組組裝Hi-C建庫基因芯片一代測序動植物基因組de novo測序細菌基因組測序真菌基因組測序病毒基因組測序簡化基因組遺傳圖譜測序簡化基因組GWAS測序基因組重測序表觀組基因分型外顯子捕獲目標區域捕獲簡化基因組遺傳圖譜性狀定位掃描圖DNA中5-hmC圖譜測定全基因組甲基化測序真菌基因組掃描圖測序epiGBS-簡化甲基化BSA混池測序基因組SSR開發基因組(DNA)UMI-RNAseq轉錄組測序真核有參轉錄組測序真核無參轉錄組測序原核鏈特異性轉錄組測序全轉錄組測序circRNA測序Lnc RNA測序Small RNA測序circRNA芯片表達譜芯片m6A甲基化測序互作轉錄組測序降解組測序UMI-RNAseqSLAM-seq測序(RNA代謝測序)轉錄組(RNA)三代全長擴增子Meta-Barcoding(eDNA)技術研究微生物多樣性二代測序宏基因組測序宏基因組Binning分析宏基因組抗性基因測序HiC-Meta宏基因組宏轉錄組差異表達測序宏病毒組測序環境DNAHiFi-Meta宏基因組腸道菌群臨床檢測基于腸道菌群檢測和移植的腸道微生態學科建設宏基因組元素循環測序三代宏基因組宏基因組免疫球蛋白測序(Mig-seq)腸道宏基因組絕對定量醫學宏病毒組測序微生物組蛋白組代謝組抗體芯片Raybiotech芯片蛋白芯片蛋白芯片中藥代謝組ENGINE-生物標志物檢測服務ENGINE-抗體特異性服務4D蛋白質組Raybiotech芯片OLINK精準蛋白質組學解決方案常規定量蛋白質組蛋白質組定性分析靶向蛋白質組學修飾蛋白質組學非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學新一代代謝組學 NGM ProLenioBio無細胞蛋白表達系統ALAMAR超靈敏蛋白組學及蛋白標志物轉化平臺超高深度血液蛋白質組蛋白和代謝組GC-MS全代謝組LC-MS全代謝組靶向代謝組脂質組學代謝組學反向色譜柱原理的DNA/RNA提取技術分子生物學CRISPR基因編輯細胞定制細胞株構建iPS構建CRISPR/Cas9DNA甲基化修飾細胞FAQ基因編輯切片圖像掃描組織芯片免疫組化微量基因組建庫專家病理切片數字存檔多色免疫熒光組織透明化技術服務病理形態學數據陪護擴增子時序分析基因突變體克隆動物中心小動物疾病模型構建和檢測服務基因編輯小鼠動物實驗支原體污染檢測服務細胞系遺傳背景鑒定細胞系鑒定外泌體全轉錄組測序外泌體分離與鑒定PBA單外泌體鄰近編碼技術PBA單外泌體蛋白質組學分析服務PBA單外泌體蛋白組樣本指南PBA外泌體免疫相關文獻外泌體專題甲基化APOBEC偶聯甲基化測序ACE-seq焦磷酸測序cfDNA甲基化測序DNA甲基化測序850K甲基化芯片935K甲基化芯片全基因組甲基化測序(WGBS)簡化基因組甲基化測序 (RRBS)目標區域甲基化測序 (Targeted Bisulfite Sequencing)甲基化DNA免疫沉淀測序 (MeDIP-seq)氧化-重亞硫酸鹽測序 (oxBS-seq)TET-重亞硫酸鹽測序(TAB-seq)5hmC-Seal,超高靈敏度的羥甲基化檢測羥甲基化免疫共沉淀測序 (hMeDIP-seq)DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)甲基化專題RNA修飾研究專題免疫印跡(Western-blot)技術服務定量Western檢測Simoa單分子免疫分析qPCRCNVSNPPGM測序PCR array數字PCR精準檢測ATAC-SeqChIP-SeqRIP-Seq基因調控Ribo-seq核糖體印跡測序技術Active Ribo-seq活躍翻譯組測序技術翻譯組數據分析數據庫構建數據價值提升10x官方發布樣本準備樣本要求樣本取材以及樣本編號技巧精簡版細胞庫組織庫動物模型轉錄組樣本準備蛋白組樣本準備代謝組樣本準備Hi-C單細胞與空間轉錄組單細胞懸液外泌體Raybiotech蛋白芯片Simoa樣本準備PBA單外泌體樣本準備ASA基因分型芯片樣本準備NULISA超靈敏蛋白組樣本準備Olink 精準蛋白組樣品準備CyTOF質譜流式樣本準備樣本準備要求表單留言板SaaS 幫助搜索Mac谷歌瀏覽器2019國自然基金查詢生信相關工具集合數據分析項目信息單提交資料分享核酸抽提產品資料轉錄組軟件教學視頻微生物多樣性軟件教學視頻Lexogen產品培訓視頻Olink精準蛋白組學專題在線學習空間轉錄組文獻PBA單外泌體蛋白組文獻NULISA微量蛋白檢測文獻OLINK精準蛋白組文獻項目進度個人中心會員登錄會員注冊購物車聯系我們公眾號手機商城公司愿景知識分享文獻展示
當前位置
人類蛋白質組芯片

HuProt? 20K人類蛋白質組芯片


     

        HuProt? 20K人類蛋白質組芯片,是迄今國際最高通量的蛋白質芯片,芯片上有19,394 種人類全長蛋白質,覆蓋70%的人類基因組ORF區。重組蛋白采用酵母表達系統,逐個進行表達與純化鑒定。在芯片上每個蛋白質均設置技術重復,并設有多種質控點,確保實驗體系穩定可靠。


芯片規格

  芯片標準:1×25×76mm硅片片基,蛋白點徑~60 μm,體積0.5~1 nL;技術重復:每個蛋白點2次技術重復;熒光檢測:可使用單一或多色標簽;純化體系:所有蛋白質在非變性條件下,通過真核酵母表達體系表達純化;生產條件:溫度4-8℃,濕度30~40%點樣,4℃過夜固定,-80℃長期保存。


蛋白類別

      HuProt? 20K人類蛋白質組芯片通過化學修飾共價結合19275種人類蛋白質和119種小鼠蛋白質。這些蛋白廣泛覆蓋受體、轉錄因子、激酶、胞外基質蛋白、細胞骨架蛋白等30余種蛋白類型,可用于多種生物學功能的創新研究。



應用方向

      HuProt? 20K人類蛋白質組芯片適用于以蛋白質相互作用為基礎原理的各種研究領域,具備廣泛的應用價值。在蛋白與蛋白相互作用篩選、蛋白與核酸相互作用鑒定方面相比傳統的co-IP聯合質譜鑒定的技術路線,更加高效和準確。在小分子藥靶鑒定、單克隆抗體特異性篩選、脂類結合蛋白篩選、酶作用底物鑒定及自身抗體類biomarker的篩選等應用中,其技術優勢不可替代。


檢測原理介紹

1.蛋白質相互作用譜篩選

  蛋白質在體內基本全部以蛋白復合狀態發揮功能,對蛋白復合物成員的識別和研究是認識和理解蛋白功能的關鍵。高通量HuProt? 20K蛋白質組芯片是蛋白(抗體)互作譜鑒定的最有力工具,通過釣餌蛋白與芯片上包被的~2萬種背景信息清晰的蛋白質進行互作反應,能夠極大提高相互作用蛋白的篩選范圍和工作效率。


 HuProt? 20K與免疫共沉淀(Co-IP)比較的優勢

● 無需進行克隆構建、細胞培養和轉染等實驗;

● 無需進行免疫沉淀實驗,不受靶蛋白表達量和共沉淀效率影響;

● 直接判定互作蛋白,無需進行質譜(MS)鑒定;

更加直觀、可靠和快速,有效提高工作效率;

待測蛋白無特異性抗體仍然可以進行檢測;

待測蛋白有無純化標簽(Tag)都可以檢測;

● 體外實驗,覆蓋范圍更廣泛,可鑒定更多互作蛋白類型和靶點。


應用案例

     HCV復制機制研究--識別宿主細胞中國HCV核心蛋白的結合蛋白(J Virol. 2013, 87(10):5718. ) 詳細內容點擊查看



2.DNA/RNA結合蛋白篩選

      HuProt?20K 蛋白質組芯片可實現蛋白質與核酸(DNA/RNA)特異性結合的高通量篩選。該芯片可迅速定位與目的核酸結合的蛋白質及其背后豐富的生物信息,在轉錄因子篩選、LncRNA調控、 RNA毒性、病原微生物侵襲等研究中發揮重要作用。


 HuProt? 20K 篩選核酸結合蛋白的技術優勢

● 無需克隆構建、細胞培養和轉染實驗;

● 無需細胞核蛋白的提取,不受蛋白表達水平影響;

● 無需進行免疫沉淀實驗,不受共沉淀效率影響;

● 與EMSA、ChIP、RIP比較,更適合篩選需求;

● 直接確定結合蛋白,無需進行質譜鑒定;

● 快速可靠,各蛋白信息清晰,驗證實驗簡便;

● 體外實驗,覆蓋范圍更廣泛,可鑒定更多互作蛋白類型和靶點。


應用案例

lncRNA調控機理研究--Gomafu結合蛋白的識別(Mol Psychiatr. 2013; 45(30): 1-9)詳細內容點擊查看



3.疾病標志物研究:自身抗體譜篩選

     腫瘤、炎癥、自身免疫性疾病(如:紅斑狼瘡、類風關、克隆氏病、多發性硬化)等多種疾病中,體內產生和累積大量的自身抗體。HuProt? 20K蛋白質組芯片覆蓋~20000種人類蛋白質,能夠結合并大規模篩選這些人類自身抗體,從而為多種疾病的診斷、預后、藥效評價等提供豐富候選標志物。


HuProt? 20K用于biomarker篩選的技術優勢

● 芯片覆蓋近2萬種人類蛋白質,通量高,獲得biomarker可能性大;

● 較質譜技術更適用于血清/血漿蛋白篩選;

● 特別適合自身免疫病及自身抗體類疾病標志物的篩選;

● 可追溯組織中自身抗體對應抗原的異常,理解發病機理;

● 可訂制小芯片,用于擴大樣本驗證實驗;

● 研究成果的轉化應用和開發有極強便利性。


應用案例

  人類蛋白質組芯片技術應用于移植排斥標志物篩選(Clin J Am Soc Nephro.2012;23:750–763) 詳細內容點擊查看



4.蛋白修飾與酶底物譜鑒定

      HuProt? 20K蛋白質組芯片包含的~2萬種真核生物酵母表達的人類全長蛋白質,這些蛋白具備充分的生物活性, 可以為多種蛋白修飾 (如磷酸化、甲基化、乙酰化、泛素化、SUMO化、NEDD化及亞硝基化等) 及酶促反應提供大量的候選底物,且每種蛋白生物信息背景清晰。以泛素化檢測為例,如下圖所示:


HuProt? 20K 用于酶底物譜鑒定的技術優勢

● 芯片覆蓋近2萬種人類蛋白質,通量高,底物鑒定范圍全面;

● 可進行多種修飾酶底物譜鑒定,應用范圍廣;

● 驗證效率高,實驗結果準確、全面、創新性強;

● 底物背景信息清晰,方便進行生物信息分析和深入機理解。



應用案例

人類蛋白質組芯片技術應用于FAK激酶新底物識別(Int J Biol Sci.2015;11(4):404-410)  詳細內容點擊查看



5.小分子&單抗藥物靶點篩選

  化學小分子和單克隆抗體是目前最主要的靶向藥物來源,然而經典的藥物研發體系往往需要15-20年的時間才能開發出適用于臨床的靶向藥物,且研發失敗率非常高。      HuProt? 20K 蛋白質組芯片是迄今為止最為簡便、快速和準確的藥物靶點篩選實驗技術,該芯片可以快速地定性和相對定量地分析經過熒光、生物素、放射性同位素標記的小分子或單克隆抗體藥物與~2萬種人類全長蛋白質的結合情況,判斷候選分子的結合靶點和特異性,為藥物研發體系的改進提供強大的技術保障。


ZEB2單抗特異性研究實例展示

A.檢驗HuProt? 20K 芯片質量:綠色熒光點(anti-GST),紅色熒光點(Positive Control),白色方框(ZEB2蛋白);

B.競爭藥廠的ZEB2單抗特異性檢測結果:白色方框(ZEB2蛋白),白色箭頭(抗體結合非特異蛋白);

C.本藥廠的ZEB2單抗特異性檢測結果:白色方框(ZEB2蛋白)。

結論:本藥廠的ZEB2單抗靶點單一,較競爭藥廠的單抗藥物特異性更強,具有更優的應用價值。


應用案例

人類蛋白質組芯片技術應用于單克隆抗體識別研究(Mol Cell Proteomics, 2012, 11(6)) 詳細內容點擊查看



最新代表文獻


蛋白質相互作用譜篩選


1.Jung J G, et al. Notch3 Interactome Analysis Identified WWP2 as a Negative Regulator of Notch3 Signaling in Ovarian Cancer. PLoS genet, 2014, 10(10): e1004751.

2.Deng RP, et al. Global identification of O-GlcNAc transferase (OGT) interactors by a human proteome microarray and theconstruction of an OGT interactome. Proteomics. 2014;14(9):1020-30

3.Staudt N, et al. Development of an antigen microarray for high throughput monoclonal antibody selection. Biochem Biophys Res Commun. 2014; 445(4): 785-90.

4.Ma TM, et al. Serine Racemase Regulated by Binding to Stargazin and PSD-95. J Biol Chem. 2014(289): 29631-29641.

5.Chen Y, et al., Bcl2-associated athanogene 3 interactome analysis reveals a new role in modulating proteasome activity. Mol Cell Proteomics. 2013; 12(10): 2804-19.

6.Varjosalo M, et al. The protein interaction landscape of the human CMGC kinase group. Cell Rep, 2013, 3(4): 1306-1320.



DNA/RNA結合蛋白篩選


1.Howarth M M, et al. Long noncoding RNA EWSAT1-mediated gene repression facilitates Ewing sarcoma oncogenesis. J Clin Invest. 2014, 124(124 (12)): 5275-5290.

2.Kretz M, et al. Control of somatic tissue differentiation by the long non-coding RNA TINCR. Nature, 2013, 493(7431): 231-235.

3.Fan B, et al. A human proteome microarray identifies that the heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K (hnRNP K) recognizes the 5‘ terminal sequence of the hepatitis C virus RNA. Mol Cell Proteomics. 2014; 13(1): 84-92.

4.Donnelly C J, et al. RNA toxicity from the ALS/FTD C9ORF72 expansion is mitigated by antisense intervention.Neuron, 2013, 80(2): 415-428.



自身抗體譜篩選


1. Delville M, et al. A circulating antibody panel for pretransplant prediction of FSGS recurrence after kidney transplantation. Sci Transl Med, 2014, 6(256): 256ra136-256ra136.

2. Bonsignori M, et al. An autoreactive antibody from an SLE/HIV-1individual broadly neutralizes HIV-1. J Clin Invest.2014, 124(4): 1835.

3. Taguchi A, Taylor AD, Rodriguez J, et al. A Search for Novel Cancer/Testis Antigens in Lung Cancer Identifies VCX/Y Genes, Expanding the Repertoire of Potential Immunotherapeutic Targets. Cancer Res, 2014, 74(17): 4694-4705.

4. Yang G, Holl T M, Liu Y, et al. Identification of autoantigens recognized by the 2F5 and 4E10 broadly neutralizing HIV-1 antibodies. J Exp Med, 2013, 210(2): 241-256.

5.  Mias GI, et al. Specific plasma autoantibody reactivity in myelodysplastic syndromes. Sci Rep. 2013; 3: 3311.

6.  Charpin C, et al. New autoantibodies in early rheumatoid arthritis. Arthritis Res Ther, 2013, 15(4): R78.

7.  Zingaretti C, et al. Identification of new autoantigens by protein array indicates a role for IL4 neutralization in autoimmune hepatitis. Mol Cell Proteomics. 2012; 11(12): 1885-97.

8.  Sigdel TK, et al. Non-HLA antibodies to immunogenic epitopes predict the evolution of chronic renal allograft injury. J Am Soc Nephrol. 2012; 23(4): 750-63.



蛋白修飾與酶底物譜鑒定


1. Dwyer S F, et al. Identification of Novel Focal Adhesion Kinase Substrates: Role for FAK in NFκB Signaling. Int J Biol SCI. 2015, 11(4): 404.

2. Lee Y I, Giovinazzo D, Kang H C, et al. Protein microarray characterization of the S-nitrosoproteome. Mol Cell Proteomics, 2014, 13(1): 63-72.

3. Moore K E, et al. A general molecular affinity strategy for global detection and proteomic analysis of lysine methylation. Mol cell, 2013, 50(3): 444-456.

4. Feijs K L, et al. ARTD10 substrate identification on protein microarrays: regulation of GSK3beta by mono-ADP-ribosylation. Cell Commun Signal, 2013, 11(5).

5. Radu M, Rawat S J, Beeser A, et al. ArhGAP15, a Rac-specific GTPase-activating protein, plays a dual role in inhibiting small GTPase signaling. J Biol Chem, 2013, 288(29): 21117-21125.

6. Tarrant M K, Rho H S, Xie Z, et al. Regulation of CK2 by phosphorylation and O-GlcNAcylation revealed by semisynthesis. Nat Chem Biol. 2012, 8(3): 262-269.



小分子&單抗藥物靶點篩選


1. Liu, S et al. Characterization of monoclonal antibody‘s binding kinetics using oblique-incidence reflectivity difference approach.Taylor & Francis.2015; 7:110-119.

2. Jeong J S, et al. Rapid identification of monospecific monoclonal antibodies using a human proteome microarray.Molecular & Cellular Proteomics, 2012, 11(6): O111. 016253.

3. To C, et al. Synthetic triterpenoids target the Arp2/3 complex and inhibit branched actin polymerization. J Biol Chem.2010; 285(36): 27944-57.


細胞貼壁細胞:預估細胞數量達到1×107個以上,移出培養箱后盡快去除培養液后用PBS洗滌2次,去除PBS,加入裂解...
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