測試調用測試設計Survival生存曲線繪制軟件環境微生物多樣性軟件轉錄組分析軟件轉錄組軟件購買重測序軟件環境微生物多樣性軟件(1)桌面軟件中藥空間代謝組學檢測中藥非靶代謝組檢測中藥活性成分鑒定中藥入血/入靶成分分析中藥組學ATAC-seqCHIP-seqHi-C測序基因調控OmicsBeanMicrobe Trakr(微生物基因組鑒定分析工具)網頁分析系統WEB分析系統澳洲血清 BovineBD科研管KAPAQIAGENThermoFisherMVE液氮罐4titude? 樣品管標記系統Hi-C建庫試劑盒及基因組組裝軟件無血清細胞凍存液Cell Freezing Medium納米流式檢測儀lexogen支原體檢測試劑盒儀器試劑耗材數據庫開發數據中心TCGA生存數據包功能醫學報告系統開發PlantArray植物生理組平臺特色服務單細胞測序空間轉錄組測序空間代謝組DSP空間蛋白質組空間多組學類器官葉綠體、線粒體基因組測序染色體級別基因組組裝Hi-C建庫基因芯片一代測序動植物基因組de novo測序細菌基因組測序真菌基因組測序病毒基因組測序簡化基因組遺傳圖譜測序簡化基因組GWAS測序基因組重測序表觀組基因分型外顯子捕獲目標區域捕獲簡化基因組遺傳圖譜性狀定位掃描圖DNA中5-hmC圖譜測定全基因組甲基化測序真菌基因組掃描圖測序epiGBS-簡化甲基化BSA混池測序基因組SSR開發基因組(DNA)UMI-RNAseq轉錄組測序真核有參轉錄組測序真核無參轉錄組測序原核鏈特異性轉錄組測序全轉錄組測序circRNA測序Lnc RNA測序Small RNA測序circRNA芯片表達譜芯片m6A甲基化測序互作轉錄組測序降解組測序UMI-RNAseqSLAM-seq測序(RNA代謝測序)轉錄組(RNA)三代全長擴增子Meta-Barcoding(eDNA)技術研究微生物多樣性二代測序宏基因組測序宏基因組Binning分析宏基因組抗性基因測序HiC-Meta宏基因組宏轉錄組差異表達測序宏病毒組測序環境DNAHiFi-Meta宏基因組腸道菌群臨床檢測基于腸道菌群檢測和移植的腸道微生態學科建設宏基因組元素循環測序三代宏基因組宏基因組免疫球蛋白測序(Mig-seq)腸道宏基因組絕對定量醫學宏病毒組測序微生物組蛋白組代謝組抗體芯片Raybiotech芯片蛋白芯片蛋白芯片中藥代謝組ENGINE-生物標志物檢測服務ENGINE-抗體特異性服務4D蛋白質組Raybiotech芯片OLINK精準蛋白質組學解決方案常規定量蛋白質組蛋白質組定性分析靶向蛋白質組學修飾蛋白質組學非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學新一代代謝組學 NGM ProLenioBio無細胞蛋白表達系統ALAMAR超靈敏蛋白組學及蛋白標志物轉化平臺超高深度血液蛋白質組蛋白和代謝組GC-MS全代謝組LC-MS全代謝組靶向代謝組脂質組學代謝組學反向色譜柱原理的DNA/RNA提取技術分子生物學CRISPR基因編輯細胞定制細胞株構建iPS構建CRISPR/Cas9DNA甲基化修飾細胞FAQ基因編輯切片圖像掃描組織芯片免疫組化微量基因組建庫專家病理切片數字存檔多色免疫熒光組織透明化技術服務病理形態學數據陪護擴增子時序分析基因突變體克隆動物中心小動物疾病模型構建和檢測服務基因編輯小鼠動物實驗支原體污染檢測服務細胞系遺傳背景鑒定細胞系鑒定外泌體全轉錄組測序外泌體分離與鑒定PBA單外泌體鄰近編碼技術PBA單外泌體蛋白質組學分析服務PBA單外泌體蛋白組樣本指南PBA外泌體免疫相關文獻外泌體專題甲基化APOBEC偶聯甲基化測序ACE-seq焦磷酸測序cfDNA甲基化測序DNA甲基化測序850K甲基化芯片935K甲基化芯片全基因組甲基化測序(WGBS)簡化基因組甲基化測序 (RRBS)目標區域甲基化測序 (Targeted Bisulfite Sequencing)甲基化DNA免疫沉淀測序 (MeDIP-seq)氧化-重亞硫酸鹽測序 (oxBS-seq)TET-重亞硫酸鹽測序(TAB-seq)5hmC-Seal,超高靈敏度的羥甲基化檢測羥甲基化免疫共沉淀測序 (hMeDIP-seq)DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)甲基化專題RNA修飾研究專題免疫印跡(Western-blot)技術服務定量Western檢測Simoa單分子免疫分析qPCRCNVSNPPGM測序PCR array數字PCR精準檢測ATAC-SeqChIP-SeqRIP-Seq基因調控Ribo-seq核糖體印跡測序技術Active Ribo-seq活躍翻譯組測序技術翻譯組數據分析數據庫構建數據價值提升10x官方發布樣本準備樣本要求樣本取材以及樣本編號技巧精簡版細胞庫組織庫動物模型蛋白組代謝組Hi-C單細胞與空間轉錄組單細胞懸液外泌體Raybiotech蛋白芯片Simoa樣本準備PBA單外泌體樣本準備ASA基因分型芯片樣本準備樣本準備要求表單留言板SaaS 幫助搜索Mac谷歌瀏覽器2019國自然基金查詢生信相關工具集合數據分析項目信息單提交資料分享核酸抽提產品資料轉錄組軟件教學視頻微生物多樣性軟件教學視頻Lexogen產品培訓視頻Olink精準蛋白組學專題在線學習項目進度個人中心會員登錄會員注冊購物車聯系我們公眾號手機商城公司愿景知識分享文獻展示
當前位置
宏基因組測序

01

產品介紹

宏基因組(metagenome是指特定環境中全部生物(微生物)遺傳物質的總和。宏基因組測序以特定環境中的整個微生物群落作為研究的對象,不需對微生物進行分離培養,而是提取環境微生物總DNA進行研究。其擺脫了傳統研究中微生物分離培養的技術限制,在基因組水平解讀微生物群體的多樣性和豐度,探索微生物與環境及宿主之間的關系。目前,第二代高通量測序技術在宏基因組的研究上已被廣泛應用。第二代高通量測序平臺具有通量高、準確性高、速度快、信息全等特點,加快了宏基因組測序在鑒定低豐度的微生物群落,挖掘更多基因資源方面的應用。



02

分析流程



03

技術參數


實驗策略

測序量

項目周期

400bp左右小片段文庫

常規 10G-20G raw data

50個工作日




04

技術特色

  • 無需分離培養微生物,突破傳統純培養技術限制,為研究和開發超 99% 的未可培養微生物提供了新途徑與有效策略;

  • 基于三十余種數據庫進行功能注釋,解析微生物基因資源,為多領域挖掘生物分子機制提供助力;

  • 可以得到環境中豐度較低的微生物,為研究低豐度微生物提供了途徑;

  • 分析內容涵蓋六大分析模塊,80+分析內容,結果圖可直接用于文章發表;

  • 多組學關聯分析,可關聯代謝組等研究結果,全方面深化研究。



05

送樣要求

樣品類型

送樣要求

保存及運輸

常規土壤

采樣時應去除地表雜質,根據需要挖取相應深度(如 5~20 cm)的土壤,置于冰上運至實驗室。去除可見雜質,建議過2 mm 無菌篩網。同一樣方多點樣本等量混合均勻后取 5~10 g,保存無菌 EP 管中。

樣本-80℃或液氮中長期保存,干冰運輸
根際土壤

矮小植物:收集植物植株,去除根部大塊土壤;搖動植株去除松散土壤,使用無菌刷子收集根部附著緊密的土壤;同一樣方多點樣本等量混合均勻,過2mm篩后,分裝至2mL或更大體積的EP管或凍存管中;每管土壤含量大概0.25~0.5g,需保證送樣量在1~2g

高大林木:采集地面下10-20cm根際土壤,置于冰上運至實驗室。去除可見雜質,建議過2-5 mm 無菌篩網。同一樣方多點樣本等量混合均勻后取 5~10 g,保存無菌 EP 管中。

水體

采樣后進行濾膜過濾,選擇合適孔徑的濾膜,對于澄清水體或者略渾濁水體,選用0.22μm 或者 0.45μm 的濾膜,取樣體積大于 5L;對于渾濁水體,建議先用3-4cm 濾膜過濾一遍,再用小孔徑的濾膜過濾;送樣量:濾膜 1-2 張;水體泥樣的采集提供大于 5g 樣本。

活性污泥
地表沉積物

活性污泥:從活性污泥裝置中取大于 10 ml 的懸浮污泥樣本(約 5-10 g 沉降物),保存無菌 EP 管中,放入液氮或置于冰上,立即運至實驗室。若液態污泥樣本沉降物較少,可適當增加取樣量。

水體/地表沉積物:取距離水底/地表 0-10 cm(具體按實驗需要而定)的沉積物 5~10 g,保存無菌取樣袋或EP 管中,置于冰上運送至實驗室。

空氣

使用空氣抽濾機,使空氣通過 0.22 μm 濾膜,濾膜上有可見覆蓋物(過濾時間越長,收集的空氣中的灰塵越多,菌數量越多),收集完成后取下濾膜。濾膜置于凍存管中,液氮速凍,干冰寄送到實驗室。

糞便

無菌牙簽或用無菌勺挖取糞便中段沒有接觸空氣和地面的部分,挖取一滿勺(3-5 g)。小鼠至少 3-5 粒糞便。將已取的糞便樣品分裝至2mL EP管(無菌)或凍存管(無菌)中,每管糞便量為0.5~2g,每個樣品分裝2~3管備份。

腸道內容物

在實驗對象死亡后,無菌條件下,取出整個腸道,用無菌解剖刀切取所需腸段的,用無菌手術刀挖取內容物 ,立即放在冰上進行分裝并標記,分裝至2mL EP管(無菌)或凍存管(無菌)中,每管組織量為0.5~2g,每個樣品分裝2~3管備份





06

分析示例


宏2.png

多樣本物種分布條形圖




宏3.png

相關性heatmap


宏4.png

多樣本RDA/CCA分析



宏5.png

STAMP 分析(樣本間)