測(cè)試調(diào)用測(cè)試設(shè)計(jì)Survival生存曲線繪制軟件環(huán)境微生物多樣性軟件轉(zhuǎn)錄組分析軟件轉(zhuǎn)錄組軟件購(gòu)買重測(cè)序軟件環(huán)境微生物多樣性軟件(1)桌面軟件中藥空間代謝組學(xué)檢測(cè)中藥非靶代謝組檢測(cè)中藥活性成分鑒定中藥入血/入靶成分分析中藥組學(xué)ATAC-seqCHIP-seqHi-C測(cè)序基因調(diào)控OmicsBeanMicrobe Trakr(微生物基因組鑒定分析工具)網(wǎng)頁分析系統(tǒng)WEB分析系統(tǒng)澳洲血清 BovineBD科研管KAPAQIAGENThermoFisherMVE液氮罐4titude? 樣品管標(biāo)記系統(tǒng)Hi-C建庫(kù)試劑盒及基因組組裝軟件無血清細(xì)胞凍存液Cell Freezing Medium納米流式檢測(cè)儀lexogen支原體檢測(cè)試劑盒儀器試劑耗材數(shù)據(jù)庫(kù)開發(fā)數(shù)據(jù)中心TCGA生存數(shù)據(jù)包功能醫(yī)學(xué)報(bào)告系統(tǒng)開發(fā)PlantArray植物生理組平臺(tái)特色服務(wù)單細(xì)胞測(cè)序空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序空間代謝組DSP空間蛋白質(zhì)組空間多組學(xué)類器官葉綠體、線粒體基因組測(cè)序染色體級(jí)別基因組組裝Hi-C建庫(kù)基因芯片一代測(cè)序動(dòng)植物基因組de novo測(cè)序細(xì)菌基因組測(cè)序真菌基因組測(cè)序病毒基因組測(cè)序簡(jiǎn)化基因組遺傳圖譜測(cè)序簡(jiǎn)化基因組GWAS測(cè)序基因組重測(cè)序表觀組基因分型外顯子捕獲目標(biāo)區(qū)域捕獲簡(jiǎn)化基因組遺傳圖譜性狀定位掃描圖DNA中5-hmC圖譜測(cè)定全基因組甲基化測(cè)序真菌基因組掃描圖測(cè)序epiGBS-簡(jiǎn)化甲基化BSA混池測(cè)序基因組SSR開發(fā)基因組（DNA）UMI-RNAseq轉(zhuǎn)錄組測(cè)序真核有參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序真核無參轉(zhuǎn)錄組測(cè)序原核鏈特異性轉(zhuǎn)錄組測(cè)序全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序circRNA測(cè)序Lnc RNA測(cè)序Small RNA測(cè)序circRNA芯片表達(dá)譜芯片m6A甲基化測(cè)序互作轉(zhuǎn)錄組測(cè)序降解組測(cè)序UMI-RNAseqSLAM-seq測(cè)序（RNA代謝測(cè)序）轉(zhuǎn)錄組（RNA）三代全長(zhǎng)擴(kuò)增子Meta-Barcoding（eDNA）技術(shù)研究微生物多樣性二代測(cè)序宏基因組測(cè)序宏基因組Binning分析宏基因組抗性基因測(cè)序HiC-Meta宏基因組宏轉(zhuǎn)錄組差異表達(dá)測(cè)序宏病毒組測(cè)序環(huán)境DNAHiFi-Meta宏基因組腸道菌群臨床檢測(cè)基于腸道菌群檢測(cè)和移植的腸道微生態(tài)學(xué)科建設(shè)宏基因組元素循環(huán)測(cè)序三代宏基因組宏基因組免疫球蛋白測(cè)序（Mig-seq）腸道宏基因組絕對(duì)定量醫(yī)學(xué)宏病毒組測(cè)序微生物組蛋白組代謝組抗體芯片Raybiotech芯片蛋白芯片蛋白芯片中藥代謝組ENGINE-生物標(biāo)志物檢測(cè)服務(wù)ENGINE-抗體特異性服務(wù)4D蛋白質(zhì)組Raybiotech芯片OLINK精準(zhǔn)蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案常規(guī)定量蛋白質(zhì)組蛋白質(zhì)組定性分析靶向蛋白質(zhì)組學(xué)修飾蛋白質(zhì)組學(xué)非靶向代謝組學(xué)靶向代謝組學(xué)脂質(zhì)組學(xué)新一代代謝組學(xué) NGM ProLenioBio無細(xì)胞蛋白表達(dá)系統(tǒng)ALAMAR超靈敏蛋白組學(xué)及蛋白標(biāo)志物轉(zhuǎn)化平臺(tái)超高深度血液蛋白質(zhì)組蛋白和代謝組GC-MS全代謝組LC-MS全代謝組靶向代謝組脂質(zhì)組學(xué)代謝組學(xué)反向色譜柱原理的DNA/RNA提取技術(shù)分子生物學(xué)CRISPR基因編輯細(xì)胞定制細(xì)胞株構(gòu)建iPS構(gòu)建CRISPR/Cas9DNA甲基化修飾細(xì)胞FAQ基因編輯切片圖像掃描組織芯片免疫組化微量基因組建庫(kù)專家病理切片數(shù)字存檔多色免疫熒光組織透明化技術(shù)服務(wù)病理形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)陪護(hù)擴(kuò)增子時(shí)序分析基因突變體克隆動(dòng)物中心小動(dòng)物疾病模型構(gòu)建和檢測(cè)服務(wù)基因編輯小鼠動(dòng)物實(shí)驗(yàn)支原體污染檢測(cè)服務(wù)細(xì)胞系遺傳背景鑒定細(xì)胞系鑒定外泌體全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序外泌體分離與鑒定PBA單外泌體鄰近編碼技術(shù)PBA單外泌體蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)PBA單外泌體蛋白組樣本指南PBA外泌體免疫相關(guān)文獻(xiàn)外泌體專題甲基化APOBEC偶聯(lián)甲基化測(cè)序ACE-seq焦磷酸測(cè)序cfDNA甲基化測(cè)序DNA甲基化測(cè)序850K甲基化芯片935K甲基化芯片全基因組甲基化測(cè)序（WGBS）簡(jiǎn)化基因組甲基化測(cè)序 (RRBS)目標(biāo)區(qū)域甲基化測(cè)序 (Targeted Bisulfite Sequencing)甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序 (MeDIP-seq)氧化-重亞硫酸鹽測(cè)序 (oxBS-seq)TET-重亞硫酸鹽測(cè)序(TAB-seq)5hmC-Seal，超高靈敏度的羥甲基化檢測(cè)羥甲基化免疫共沉淀測(cè)序 (hMeDIP-seq)DNA 6mA免疫沉淀測(cè)序 (6mA-IP Seq)甲基化專題RNA修飾研究專題免疫印跡(Western-blot)技術(shù)服務(wù)定量Western檢測(cè)Simoa單分子免疫分析qPCRCNVSNPPGM測(cè)序PCR array數(shù)字PCR精準(zhǔn)檢測(cè)ATAC-SeqChIP-SeqRIP-Seq基因調(diào)控Ribo-seq核糖體印跡測(cè)序技術(shù)Active Ribo-seq活躍翻譯組測(cè)序技術(shù)翻譯組數(shù)據(jù)分析數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建數(shù)據(jù)價(jià)值提升10x官方發(fā)布樣本準(zhǔn)備樣本要求樣本取材以及樣本編號(hào)技巧精簡(jiǎn)版細(xì)胞庫(kù)組織庫(kù)動(dòng)物模型蛋白組代謝組Hi-C單細(xì)胞與空間轉(zhuǎn)錄組單細(xì)胞懸液外泌體Raybiotech蛋白芯片Simoa樣本準(zhǔn)備PBA單外泌體樣本準(zhǔn)備ASA基因分型芯片樣本準(zhǔn)備樣本準(zhǔn)備要求表單留言板SaaS 幫助搜索Mac谷歌瀏覽器2019國(guó)自然基金查詢生信相關(guān)工具集合數(shù)據(jù)分析項(xiàng)目信息單提交資料分享核酸抽提產(chǎn)品資料轉(zhuǎn)錄組軟件教學(xué)視頻微生物多樣性軟件教學(xué)視頻Lexogen產(chǎn)品培訓(xùn)視頻Olink精準(zhǔn)蛋白組學(xué)專題在線學(xué)習(xí)項(xiàng)目進(jìn)度個(gè)人中心會(huì)員登錄會(huì)員注冊(cè)購(gòu)物車聯(lián)系我們公眾號(hào)手機(jī)商城公司愿景知識(shí)分享文獻(xiàn)展示
當(dāng)前位置
lncRNA測(cè)序

長(zhǎng)鏈非編碼RNA（long non-coding RNA，lncRNA）是一類轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過200nt、不編碼蛋白的RNA。利用新一代高通量測(cè)序技術(shù)進(jìn)行l(wèi)ncRNA測(cè)序，并結(jié)合生物信息學(xué)的預(yù)測(cè)工具進(jìn)行l(wèi)ncRNA分析，有助于科研工作者更快發(fā)現(xiàn)那些具有重要調(diào)控功能的lncRNA，分析其與特定生物學(xué)過程的關(guān)系。該方法可以更加有效地獲取lncRNA序列以及位置信息，且突破了常規(guī)lncRNA芯片檢測(cè)技術(shù)的使用范圍限制，還可對(duì)新的lncRNA進(jìn)行預(yù)測(cè)及功能分析，極大促進(jìn)lncRNA的深入研究。

技術(shù)穩(wěn)定，建庫(kù)重復(fù)性好
同一樣本重復(fù)建庫(kù)相關(guān)性Pearson值大于0.993
高特異性
使用特定方法降低樣本中rRNA的豐度
高準(zhǔn)確度
構(gòu)建鏈特異性轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)，快速、有效、準(zhǔn)確地獲取樣本中幾乎全部的lncRNA序列及其位置信息
分析嚴(yán)格
系統(tǒng)鑒定已知lncRNA，設(shè)置嚴(yán)格的篩選條件用于發(fā)現(xiàn)新的lncRNA
特色lncRNA高級(jí)分析
lncRNA cis和trans調(diào)控機(jī)制以及ceRNA調(diào)控機(jī)制等
經(jīng)驗(yàn)豐富
已對(duì)多種動(dòng)植物的lncRNA進(jìn)行測(cè)序分析
案例展示
案例一   梗阻性黃疸大鼠模型胸段脊髓的 lncRNA 表達(dá)特征分析
研究背景
脊髓中包含復(fù)雜的功能基因和長(zhǎng)鏈非編碼 RNA，深刻地影響病理性疾病的發(fā)生和發(fā)展。盡管阻塞性黃疸在多種臨床疾病中已有報(bào)道，但胸段脊髓中 lncRNA 表達(dá)模式仍有待于探究。
研究?jī)?nèi)容
我們攜手河北醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院，共同探究阻塞性黃疸模型胸段脊髓的 mRNA 和 lncRNA 的表達(dá)模式，其中 mRNA和   lncRNA 的測(cè)序和分析工作由我們完成。該文章利用 lncRNA 測(cè)序探究胸段脊髓中 lncRNA 表達(dá)特征，通過 GO 和 KEGG 富集分析對(duì)基因功能進(jìn)行注釋，研究了隨著時(shí)間變化，阻塞性黃疸模型胸段脊髓的 mRNA 和 lncRNA 表達(dá)模式特征。

lncrna

研究結(jié)果
1. 構(gòu)建大鼠阻塞性黃疸模型，發(fā)現(xiàn) BDL 組大鼠的耳朵呈現(xiàn)黃色、血清總膽紅素水平升高。
2. 對(duì)實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組進(jìn)行脊髓 lncRNA 測(cè)序，通過散點(diǎn)圖和熱圖對(duì)結(jié)果進(jìn)行特征分析，共篩選獲得 2800 個(gè)差異 mRNAs 以及 2033 個(gè)差異 lncRNAs，并對(duì)差異表達(dá)的 mRNA 進(jìn)行 GO 和 KEGG 功能注釋。
3. qRT-PCR 驗(yàn)證差異基因的表達(dá)，挑選 5 個(gè)上調(diào) lncRNA 和 5 個(gè)下調(diào) lncRNA 進(jìn)行驗(yàn)證，結(jié)果發(fā)現(xiàn) NONRATT002335 和 NONRATT018085 的表達(dá)量顯著上調(diào)，NONRATT025415、NONRATT025388 以及 NONRATT025409 的表達(dá)量顯著下調(diào)。
4. 對(duì)模型組 14 天和 18 天的 lncRNA 表達(dá)進(jìn)行差異分析發(fā)現(xiàn)，NONRATT002335 和 NONRATT018085 的表達(dá)量顯著上調(diào)，NONRATT025415、NONRATT025388 和 NONRATT025409 的表達(dá)量顯著下調(diào)。
參考文獻(xiàn)
Wang Q, Li ZX, Liu BW, et al. Altered expression of differential gene and lncRNA in the lower thoracic spinal cord on different time courses of experimental obstructive jaundice model accompanied with altered peripheral nociception in rats. Oncotarget 2017; 8(62): 106098-106112. (IF: 5.168)
常見問題
1. lncRNA 測(cè)序建庫(kù)與常規(guī)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的區(qū)別是什么？
長(zhǎng)鏈非編碼 RNA 建庫(kù)主要通過去除 rRNA，構(gòu)建鏈特異性文庫(kù)。不同于常規(guī)轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目基于 polyA 富集，是因?yàn)橛醒芯堪l(fā)現(xiàn)細(xì)胞內(nèi)一部分（>24%）的長(zhǎng)鏈非編碼 RNA 都是缺少 polyA 尾的。鏈特異建庫(kù)有助于我們確定轉(zhuǎn)錄的方向，并使得反義轉(zhuǎn)錄本的定量更為準(zhǔn)確。而常規(guī)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序一般不要求構(gòu)建鏈特異性文庫(kù)。
2. lncRNA 測(cè)序獲得的差異 lncRNA 如何進(jìn)行篩選？
首先可以根據(jù) fold change 值和 p value 對(duì)差異 lncRNA 進(jìn)行篩選，然后通過 lncRNA 和 mRNA 共表達(dá)分析，從關(guān)鍵基因或關(guān)鍵信號(hào)通路層面入手去鎖定目標(biāo) lncRNA，另外可以通過lncRNA高級(jí)分析從 lncRNA 的 cis 和 trans 調(diào)控機(jī)制層面入手，鎖定目標(biāo) lncRNA。