測試調用測試設計Survival生存曲線繪制軟件環境微生物多樣性軟件轉錄組分析軟件轉錄組軟件購買重測序軟件環境微生物多樣性軟件(1)桌面軟件中藥空間代謝組學檢測中藥非靶代謝組檢測中藥活性成分鑒定中藥入血/入靶成分分析中藥組學ATAC-seqCHIP-seqHi-C測序基因調控OmicsBeanMicrobe Trakr(微生物基因組鑒定分析工具)網頁分析系統WEB分析系統澳洲血清 BovineBD科研管KAPAQIAGENThermoFisherMVE液氮罐4titude? 樣品管標記系統Hi-C建庫試劑盒及基因組組裝軟件無血清細胞凍存液Cell Freezing Medium納米流式檢測儀lexogen支原體檢測試劑盒儀器試劑耗材數據庫開發數據中心TCGA生存數據包功能醫學報告系統開發PlantArray植物生理組平臺特色服務單細胞測序空間轉錄組測序空間代謝組DSP空間蛋白質組FFPE石蠟包埋組織單細胞轉錄組解決方案:10×Flex空間多組學類器官葉綠體、線粒體基因組測序染色體級別基因組組裝Hi-C建庫基因芯片一代測序動植物基因組de novo測序細菌基因組測序真菌基因組測序病毒基因組測序簡化基因組遺傳圖譜測序簡化基因組GWAS測序基因組重測序表觀組基因分型外顯子捕獲目標區域捕獲簡化基因組遺傳圖譜性狀定位掃描圖DNA中5-hmC圖譜測定全基因組甲基化測序真菌基因組掃描圖測序epiGBS-簡化甲基化BSA混池測序基因組SSR開發基因組(DNA)UMI-RNAseq轉錄組測序真核有參轉錄組測序真核無參轉錄組測序原核鏈特異性轉錄組測序全轉錄組測序circRNA測序Lnc RNA測序Small RNA測序circRNA芯片表達譜芯片m6A甲基化測序互作轉錄組測序降解組測序UMI-RNAseqSLAM-seq測序(RNA代謝測序)轉錄組(RNA)三代全長擴增子Meta-Barcoding(eDNA)技術研究微生物多樣性二代測序宏基因組測序宏基因組Binning分析宏基因組抗性基因測序HiC-Meta宏基因組宏轉錄組差異表達測序宏病毒組測序環境DNAHiFi-Meta宏基因組腸道菌群臨床檢測基于腸道菌群檢測和移植的腸道微生態學科建設宏基因組元素循環測序三代宏基因組宏基因組免疫球蛋白測序(Mig-seq)腸道宏基因組絕對定量醫學宏病毒組測序微生物組蛋白組代謝組抗體芯片Raybiotech芯片蛋白芯片蛋白芯片中藥代謝組ENGINE-生物標志物檢測服務ENGINE-抗體特異性服務4D蛋白質組Raybiotech芯片OLINK精準蛋白質組學解決方案常規定量蛋白質組蛋白質組定性分析靶向蛋白質組學修飾蛋白質組學非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學新一代代謝組學 NGM ProLenioBio無細胞蛋白表達系統ALAMAR超靈敏蛋白組學及蛋白標志物轉化平臺超高深度血液蛋白質組蛋白和代謝組GC-MS全代謝組LC-MS全代謝組靶向代謝組脂質組學代謝組學反向色譜柱原理的DNA/RNA提取技術分子生物學CRISPR基因編輯細胞定制細胞株構建iPS構建CRISPR/Cas9DNA甲基化修飾細胞FAQ基因編輯切片圖像掃描組織芯片免疫組化微量基因組建庫專家病理切片數字存檔多色免疫熒光組織透明化技術服務病理形態學數據陪護擴增子時序分析基因突變體克隆動物中心小動物疾病模型構建和檢測服務基因編輯小鼠動物實驗支原體污染檢測服務細胞系遺傳背景鑒定細胞系鑒定外泌體全轉錄組測序外泌體分離與鑒定PBA單外泌體鄰近編碼技術PBA單外泌體蛋白質組學分析服務PBA單外泌體蛋白組樣本指南PBA外泌體免疫相關文獻外泌體專題甲基化APOBEC偶聯甲基化測序ACE-seq焦磷酸測序cfDNA甲基化測序DNA甲基化測序850K甲基化芯片935K甲基化芯片全基因組甲基化測序(WGBS)簡化基因組甲基化測序 (RRBS)目標區域甲基化測序 (Targeted Bisulfite Sequencing)甲基化DNA免疫沉淀測序 (MeDIP-seq)氧化-重亞硫酸鹽測序 (oxBS-seq)TET-重亞硫酸鹽測序(TAB-seq)5hmC-Seal,超高靈敏度的羥甲基化檢測羥甲基化免疫共沉淀測序 (hMeDIP-seq)DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)甲基化專題RNA修飾研究專題免疫印跡(Western-blot)技術服務定量Western檢測Simoa單分子免疫分析qPCRCNVSNPPGM測序PCR array數字PCR精準檢測ATAC-SeqChIP-SeqRIP-Seq基因調控Ribo-seq核糖體印跡測序技術Active Ribo-seq活躍翻譯組測序技術翻譯組數據分析數據庫構建數據價值提升10x官方發布樣本準備樣本要求樣本取材以及樣本編號技巧精簡版細胞庫組織庫動物模型轉錄組樣本準備蛋白組樣本準備代謝組樣本準備Hi-C單細胞與空間轉錄組單細胞懸液外泌體Raybiotech蛋白芯片Simoa樣本準備PBA單外泌體樣本準備ASA基因分型芯片樣本準備NULISA超靈敏蛋白組樣本準備Olink 精準蛋白組樣品準備CyTOF質譜流式樣本準備樣本準備要求表單留言板SaaS 幫助搜索Mac谷歌瀏覽器2019國自然基金查詢生信相關工具集合數據分析項目信息單提交資料分享核酸抽提產品資料轉錄組軟件教學視頻微生物多樣性軟件教學視頻Lexogen產品培訓視頻Olink精準蛋白組學專題在線學習空間轉錄組文獻PBA單外泌體蛋白組文獻NULISA微量蛋白檢測文獻OLINK精準蛋白組文獻項目進度個人中心會員登錄會員注冊購物車聯系我們公眾號手機商城公司愿景知識分享文獻展示
當前位置
項目簡介
樣本要求
應用案例

甲基化DNA免疫沉淀測序(MeDIP-seq)

甲基化DNA免疫沉淀測序(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,MeDIP-Seq),

采用甲基化DNA免疫共沉淀技術,通過5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗體特異性富集基因組上發生甲基化的DNA片段測序,

可以在全基因組水平上進行高精度的CpG密集的高甲基化區域研究,

是分析基因組DNA甲基化變化的一種準確可靠的技術。

用心服務每一個項目

專注表觀組學10年,提供專業有價值的DNA甲基化完整解決方案;

最早開發MeDIP-seq技術團隊之一, 嚴格的內參質控;

已經完成人、小鼠、大鼠、豬等多個物種MeDIP-seq項目經驗;

核心團隊在Nature communications, Genome biology等雜志發表多篇SCI論文;

專業的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。

科學方案設計

從項目方案、樣本處理、建庫測序,到數據分析;

每個項目需要專業、有價值的建議;及時高效的溝通,以保障高質量研究成果。

樣本類型和要求

樣本類型

樣本要求

基因組DNA

總量≥ 3ug; 濃度≥ 30ng/ul; 基于Qubit定量

細胞、全血、動植物組織等

按照送樣要求準備

備注:用封口膜密封樣品; 干冰運輸

數據分析

MeDIP

分析內容

備注

標準分析

1、測序數據質量評估

過濾掉低質量數據,保證數據質量

2、與參考基因組比對

測序Reads 在基因組上的分布

3、Peak峰Calling

甲基化DNA富集區域鑒定

4、Peak圖譜分析

Peak在基因組,染色體,功能元件上的分布

6、組間差異Peak分析

尋找DMR及注釋

7、差異Peak基因分析

相關基因GO,KEGG富集分析

高級分析

8、多組學整合關聯分析

例如與轉錄組關聯分析

9、其它定制化分析

結合課題背景亮點挖掘

案例分析:同卵雙胞胎2型糖尿病易感基因的表觀基因組關聯分析(團隊成員發表)

An integrated epigenomic analysis for type 2 diabetes susceptibility loci in monozygotic twins. Nature communications. 2014; 5: 5719.

一、研究背景

2型糖尿病(T2D)是一種高度異質性疾病,通過遺傳易感性和環境的結合引起。全基因組關聯研究(GWAS)已經鑒定出至少65個T2D位點,但這僅解釋了T2D疾病易感性的6%。T2D的變異也可能部分通過表觀遺傳效應來解釋,比如DNA甲基化。

二、方法流程

取材:27對同卵雙胞胎的全血:T2D-discordant (n=17), T2D-concordant (n=3), 對照組non-T2D group (n=7)

測序:甲基化DNA免疫沉淀測序(MeDIP-Seq)

驗證:450K芯片:差異甲基化基因

三、研究結果

1、在這項研究中,對27對同卵雙胞胎的全血DNA進行了MeDIP-Seq,發現了大量的與2型糖尿病相關基因的差異甲基化區域(DMR),并在隨后的另外一批大量樣本(42個T2D和221正常對照)的研究中得到了進一步的驗證;

2、其中MALT1基因啟動子區的甲基化變化,與血液中牛磺膽酸水平的變化直接相關,并涉及到胰島素和血糖代謝相關的信號通路;

3、DNA甲基化組與T2D相關臨床數據的分析結果表明了差異DNA甲基化區域在T2D易感性基因上的相對富集。

四、研究結論

總之,綜合基因組學和表觀基因組學的方法,加上同卵雙胎的病理模型,我們很好地解釋T2D等其他復雜性狀疾病的致病原因,并發現潛在的藥物靶標和生物標記物。