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當前位置
數據庫開發
云生物提供個性化的數據庫網站外包開發服務。定制開發的數據庫網站，能夠根據您的需求，將高通量項目成果和內容，以Web網站的形式進行呈現，提供展示、查詢、下載功能。 無論，您想做的是轉錄組數據庫網站、基因組數據庫網站、還是重測序數據庫網站，我們的開發團隊，都能夠滿足您的需要。 常見的數據庫網站模板：
2026-04-22
背景簡介細胞外囊泡（EV）因其穩定結構、跨組織屏障能力以及在血漿、尿液等體液中的豐富分布，被視為無創診斷和精準醫療的重要載體。然而EV高度異質，傳統分析往往混合全部囊泡測定，導致稀有亞群信號被稀釋。近年來，鄰近編碼分析技術（PBA）、納米流式細胞術（nFCM）、納米顆粒追蹤分析（NTA）、隨機光學重構顯微鏡（STORM）、單分子定位顯微鏡（SMLM）等技術，使單個EV分析成為可能，顯著提高靈...
2025-03-31
結構變異（Structural variation，SVs）和基因拷貝數變異（gene copy number variations，gCNVs）是動植物中主要的遺傳變異來源，對于作物進化、馴化和改良具有重要貢獻。全面準確地鑒定和分析SV和gCNV對挖掘優異等位基因、保障水稻糧食安全具有重要意義。 四川農業大學研究人員合作于2021年發表于《Cell》期刊“Pan-genom...
2025-03-31
癌癥研究一直是生命科學領域中的重中之重。近年來，RNA轉錄水平的調控機制成為癌癥研究的重要方向，影響著轉錄組多樣性和蛋白質組的構成，與人體的生理和疾病狀態息息相關。今天為大家介紹一款對癌癥研究有重大幫助的數據庫-FLIbase數據庫。這一數據庫由我們助力復旦大學何祥火課題組開發。2023年，該數據庫發表于Nucleic Acids Research期刊上，整合了長讀長和短讀長RNA測序數據，...
2025-03-26
項目名稱：GepLiver：跨越發育階段和肝病階段的綜合肝臟表達圖譜鏈接地址：www.gepliver.org項目描述：GepLiver可用于探索肝臟表型中基因和細胞類型的表達模式和轉錄組特征的演變，協助肝臟轉錄組動態的研究，并為肝臟疾病的生物標志物和靶點提供信息。合作單位：復旦大學上海腫瘤中心Cite：GepLiver: an integrative liver expression at...
2025-03-04
我們之前也對外泌體做過介紹，外泌體是由大多數細胞都可以分泌的納米級的內吞囊泡，含有大量不同類型的RNA，可以調節受體細胞的行為，并可作為疾病的循環生物標志物。今天為大家介紹一個人類血液外泌體circRNA、lncRNA和mRNA的數據庫——exoRBase。這篇文章中，作者介紹了其團隊開發了的web可訪問的數據庫exoRBase，這是一個人類血液外泌體的RNA-seq數據分析的circRNA...
2025-03-04
2020年11月，于Nucleic Acids Research雜志發表題為“RJunBase: a database of RNA splice junctions in human normal and cancerous tissues”文章，介紹整合了人類所有組織中RNA剪切位點數據庫——RJunBase。剪接是多外顯子基因RNA加工的重要步驟，能夠將內含子從前體RNA中去除，從...
2020-09-18
FerrDb鐵死亡相關的標志物和調控因子以及鐵死亡關聯疾病的數據庫正文內容：鐵死亡(Ferroptosis)是一種鐵依賴性的調節性細胞死亡方式，是區別于細胞凋亡、細胞壞死、細胞自噬的新型的細胞程序性死亡方式。鐵死亡的過程很復雜，由多種代謝物...
2020-09-16
EPD in 2020: enhanced data visualization and extension to ncRNA promoters11.501Nucleic Acids Res . 2020 Jan 8;48(D1):D65...
2020-09-09
A Comprehensive Online Database for Exploring ～20,000 Public Arabidopsis RNA-Seq Libraries12.084Mol Plant . 2020 Aug 5;S...
2020-09-02
COG是Clusters of Orthologous Groups of proteins的縮寫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/COG/)。COG是在對已完成基因組測序的物種的蛋白質序列進行相互比較的基礎上構建的...
2020-08-19
Pfam: the protein families database11.501Nucleic Acids Res . 2014 Jan;42(Database issue):D222-30. doi: 10.1093/nar/gkt12...
2020-08-12
KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes，京都基因與基因組百科全書）是一個整合了基因組、化學和系統功能信息的綜合性數據庫，旨在揭示生命現象的遺傳物質與化學藍圖。它是由日本京都大學生物信息學中心...
2020-08-05
The antiSMASH database version 2: a comprehensive resource on secondary metabolite biosynthetic gene clusters11.501Nucle...
2020-07-29
HRGFish: A database of hypoxia responsive genes in fishes3.998Sci Rep . 2017 Feb 13;7:42346. doi: 10.1038/srep42346.Abst...
2020-07-15
碳水化合物亦稱糖類化合物，是自然界存在最多、分布最廣的一類重要有機化合物，是一切生物體維持生命活動所需能量的主要來源。作用于各種糖復合物、寡糖和多糖等碳水化合物的酶類構成了地球上結構最多樣的蛋白質集合。碳水化合物活性酶數據庫（CAZymes...
2020-07-13
LnCeVar: a comprehensive database of genomic variations that disturb ceRNA network regulation11.501Nucleic Acids Res . 2...
2020-07-13
Bovine Genome Database: new annotation tools for a new reference genome11.501Nucleic Acids Res . 2020 Jan 8;48(D1):D676-...
2020-06-10
miRDB: an online database for prediction of functional microRNA targets11.147Nucleic Acids Res . 2020 Jan 8;48(D1):D127...
2020-05-26
CDG: An Online Server for Detecting Biologically Closest Disease-Causing Genes and Its Application to Primary Immunodefi...
2020-05-13
2020年3月，VG軟件團隊助力合作客戶于BMC genomics（IF=3.501）發表題為“iMarmot: an integrative platform for comparative and functional genomics... |
