數字PCR儀器:QIAGEN QIAcuity One
技術原理
數字PCR( 也可稱單分子PCR) 一般包括兩部分內容,即PCR 擴增和熒光信號分析。在PCR 擴增階段,與傳統技術不同,數字PCR 一般需要將樣品稀釋到單分子水平,并平均分配到幾十至幾萬個單元中進行反應。不同于qPCR 對每個循環進行實時熒光測定的方法,數字PCR 技術是在擴增結束后對每個反應單元的熒光信號進行采集。最后通過直接計數或泊松分布公式計算得到樣品的原始濃度或含量。數字PCR 的定量方法不依賴于擴增曲線的循環閾值,因此不受擴增效率的影響,也不必采用看家基因和標準曲線,具有很好的準確度和重現性,可以實現絕對定量分析。在未來十年內,醫學保健的目標是提供優質高效的個性化醫療。PCR 方法會在實現這個目標的過程中發揮重要作用。相比于傳統的PCR,數字PCR 技術有著無可比擬的優勢和廣泛的應用前景。 
數字PCR檢測原理

數字PCR檢測流程
應用領域
·突變/稀有變異檢測(Mutation/Rare variant detection)
·拷貝數變異(Copy-number variation)
·進入外周循環(包括血液和糞便)的腫瘤組織核酸分析
·無創產前篩查 ·轉化移植檢測 ·藥理學(Pharmacogenetics)
·基因表達分析(Gene expression analysis)-特別針對單細胞或少量細胞或者血清血漿樣品
·線粒體拷貝數分析與線粒體突變分析
·數字PCR可以驗證二代測序(NGS)
優勢
不依賴Ct值,無需標準曲線,即可實現真正的絕對定量
高精確度、高靈敏度,熒光定量qPCR靈敏度為1%-0.1%,數字化PCR靈敏度可達0.01-0.001%。
對干擾分子(背景信號、PCR抑制劑等)耐受度高,通過信號的“有”“無”定量而不是Ct值。
案例
1、數字PCR研究基因表達
遇到基因豐度非常低的,或者樣本濃度低的,可以選擇數字化PCR,通常CT值大于30的時候,熒光定量qPCR的精確度和重復性會大大降低,這個時候可考慮數字化PCR。

2、外泌體micRNA
外泌體里面的micRNA含量是非常低的,提取外泌體也是個非常費時費錢的事情,千辛萬苦提取出來的樣本,保險起見,用數字化PCR是非常不錯的一個選擇,而且也非常便宜。

3、CNV檢測

4、轉基因含量檢測

5、基因編輯結果驗證

6、SNP基因分型

7、德立替尼治療HR+/HER2-轉移性乳腺癌

8、肺癌T790M突變-cfDNA動態監測

9、白血病融合基因檢測

參考文獻
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