Visual Genomics - RS

v1.1.0 轉錄組分析軟件

• **步：安裝軟件主體

  下載VGenomics_RS_V1.1.0x64.setup.exe，安裝，點擊這里查看安裝說明！

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• 第二步：安裝KO數據文件（KEGG功能注釋）

  下載database.zip，并在軟件安裝根目錄進行解壓，點擊這里查看配置說明！

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按上述兩個步驟，完成VG轉錄組軟件的完整安裝（推薦）。如果不需要KEGG功能注釋，可以不執行步驟二。

下載，申請15天試用！關注 "VG生信軟件" 公眾號，獲取激活碼，額外增加45天 試用期限！ 點擊這里了解詳情！

測試數據

測試數據ref-based_test_rawdata.zip，相比軟件自帶測試數據，數據量相對更大一些。 點擊這里查看測試數據詳細信息！

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• 功能全面：分析內容一網打盡!

• 權威度高：分析模塊均源于公開發表的文獻中，廣受認可的算法和開源程序!

• 簡單易上手：可視化操作，零基礎、無需命令行和編程技能!

• 快速、高效：一鍵化完成分析，一鍵化導出網頁結果!

• 個性化操作：個性化修改樣品名、分組信息、個性化編輯數據和圖片!

• 配置要求低：普通電腦配置（8G，2核），即可運行!

快速開始

• 第一步：公共數據庫獲取轉錄組分析所需相關文件操作說明文檔

• 第二步：比對和定量流程說明文檔

軟件運行配置要求

• 64位Windows操作系統：Windows 7、Windows 8、Windows 10。

• 最低8G內存、2核心CPU電腦；推薦16G內存，4核心CPU電腦。

快速導航

• 安裝和試用

• 教學視頻

• 模塊幫助文檔

• 基本操作說明

• FAQ

• 數據管理和分析系統

• 關注公眾號活動

更新日志

• 增加數據預處理環節，與Ensembl基因組數據庫網站實現無縫對接。 可以直接下載Ensembl 網站上的參考序列、注釋信息等數據進行轉錄組分析， 點此查看具體操作步驟說明（重點）！

• 增加基于Diamond的KEGG功能注釋，需要下載相應的KO數據庫， 點此進行下載配置！

• 優化所有定量分析流程，統一輸出Count矩陣、FPKM矩陣、TPM矩陣。

• 增加Kalliso（alignment-free）定量功能，能夠極大地提升定量分析速度，建議使用。

• 增加T檢驗、秩和檢驗、方差分析等單一變量統計分析模塊。

• 增加共表達網絡分析、隨機森林、SVM支持向量機、logistic回歸、ROC曲線等多元統計分析模塊。

• 大量分析模塊功能和幫助文檔優化。

• 兼容性優化，BUG修復，提升軟件運行健壯性。