發現和鑒定新病毒以及確定新病毒與疾病的關系是預防、診斷和治療新發病毒性傳染病的首要任務。高通量測序技術突破了傳統技術方法的局限，可以直接以標本中所有的遺傳物質為研究對象，從而能夠快速地鑒定出標本中存在的病毒，形成了一門研究特定環境中病毒群落的新興學科：病毒宏基因組學（宏病毒組）。

傳統意義上有很多用于發現新病毒的方法，如病毒分離、核酸檢驗、血清學試驗等，但它們都有一定的局限性。但利用高通量測序發現新病毒具有信息量大、對標本所含信息無偏倚、操作較簡單、檢測成本較低等獨特優點，使得該技術已成為目前病毒發現中最為重要的技術之一，其在病毒診斷、溯源、預警等方面具有實用意義。

病毒宏基因組測序，又叫宏病毒組測序（Virome），是直接以環境樣本中所有病毒的遺傳物質為研究對象，記性病毒分析生物學檢測的技術，能夠快速準確的鑒定出環境中所有病毒的組成，在病毒發現、病毒溯源、微生物預警研究等方面有重要作用。

2018年，全球病毒組計劃 (The Global Virome Project) 啟動，旨在鑒定出地球上大部分未知病毒。豐富病毒參考數據庫如NCBI、JGI，構建新的海洋病毒數據庫（GOV）。病毒組序列鑒定分類，對于研究病毒與宿主功能互作意義重大！

直接或間接參與地球生物化學循環；

調控寄主群落結構；

病毒與寄主共進化推動地球生態系統的多樣性；

多樣本物種分布條形圖

相關性heatmap圖

多樣本RDA/CCA分析

STAMP 分析（樣本間）