所用技術作者合作單位區域文章標題發表期刊影響因子中科院分區發表年份發表月份研究內容樣本種屬樣本類型疾病類型科室解讀鏈接PBA邱海波教授團隊東南大學醫學院江蘇Endothelium-Treg Communication Through Extracellular Vesicle Transfer Exacerbates Acute Respiratory Distress SyndromeJo...
當前艾滋病主流治療為抗逆轉錄病毒治療（AntiRetroviral Therapy, ART），通過聯合用藥抑制病毒復制、修復免疫功能。研究證實，盡早啟動 ART 有望實現功能性治愈，為患者帶來新希望。目前尚無根治手段，但 ART 可有效管控病毒。臨床觀察到，部分患者停藥后病毒會快速反彈，部分則能長期抑制，背后相關生物學機制仍有待探明。近期來自格拉德斯通研究所及加州大學舊金山分校的聯合團隊在...
文章題目：IGSF11-VISTA is a critical and targetable immune checkpoint axis in diffuse midline glioma.期刊名稱：Cancer Cell影響因子：44.5DOI：10.1016/j.ccell.2025.12.020研究背景彌漫性中線膠質瘤（DMG）是兒童最致命的腦腫瘤之一，中位生存期不足一年，目前仍缺乏...
背景簡介細胞外囊泡（EV）因其穩定結構、跨組織屏障能力以及在血漿、尿液等體液中的豐富分布，被視為無創診斷和精準醫療的重要載體。然而EV高度異質，傳統分析往往混合全部囊泡測定，導致稀有亞群信號被稀釋。近年來，鄰近編碼分析技術（PBA）、納米流式細胞術（nFCM）、納米顆粒追蹤分析（NTA）、隨機光學重構顯微鏡（STORM）、單分子定位顯微鏡（SMLM）等技術，使單個EV分析成為可能，顯著提高靈...
1 文章詳情 文章題目：Spatially Resolved Multiomics Reveals Metabolic Remodeling and Autophagy Activation in Adamantinomatous Craniopharyngiomas中文題目：空間多組學技術揭示造釉細胞型顱咽管瘤的代謝重塑與自噬激活作者：Dongting Chen, Yahui Gao, Y...
文章詳情 文章題目：Integrative spatial analysis reveals tumor heterogeneity and immune colony niche related to clinical outcomes in small cell lung cancer中文題目：整合空間分析揭示小細胞肺癌腫瘤異質性和與臨床預后相關的免疫生態位發表時間：2025.2期刊名...
Microbial signals in primary and metastatic brain tumors實驗設計與技術手段CosMx SMI：在膠質瘤（n=19）和腦轉移瘤（n=9）TMA（組織芯片）上，使用Human 6K Discovery + 定制16S探針，對近10萬個單細胞進行高分辨率成像，精確定位細胞內16S信號并明確其在各類細胞中的分布。GeoMx DSP：在膠質瘤（n...
本研究采用Visium HD空間轉錄組技術，在FFPE牙齦組織上實現2×2μm級亞細胞分辨率的轉錄組捕獲。研究共納入12例受試者，包括健康對照（HC，n=4）、慢性牙周炎（P，n=4）與吸煙相關牙周炎（SP，n=4）。文章結論1.吸煙直接破壞牙齦上皮的屏障結構，使其從保護層轉變為病變易感層該圖揭示了吸煙對牙齦上皮細胞結構和功能的破壞。研究首先將牙齦上皮細胞細分為四個亞群，并將其空間分布映射回...
研究設計本研究選取3位心臟移植患者的冠狀動脈樣本，涵蓋從近正常-輕度-中度 -重度的病變連續譜，且保留血管全層結構及周圍脂肪組織。1GeoMx DSP使用~18,000探針進行全轉錄組空間分析選取CD45?免疫細胞以及CD4? T細胞用于區分ROI獲得空間區域水平的轉錄組全景2CosMx SMI使用與GeoMx相鄰的連續切片采用~970-plex RNA探針（含20個定制的基因）實現單細胞空...
實驗設計與技術手段研究共納入28例接受NAC（Neoadjuvant Chemotherapy，新輔助化療）聯合曲妥珠單抗治療的HER2?乳腺癌患者，分別收集治療前穿刺活檢樣本和治療后手術切除樣本（均為FFPE）。研究在同一患者內實現“治療前–治療后”的縱向比較，為動態分析免疫變化提供了基礎。研究主要采用NanoString GeoMx DSP平臺，在空間水平上對FFPE組織樣本進行全轉錄組...
研究方法CosMx? SMI；細胞、動物實驗。患者例數：13例非轉移PDAC患者，接受了原發腫瘤的手術切除，有或沒有新輔助化療和放療（CRT），樣本為手術切除腫瘤組織。研究結果1、細胞類型降維聚類注釋?SMI數據進行降維、聚類，并注釋出惡性，癌癥相關成纖維細胞（CAF），內皮細胞，周細胞，血管平滑肌，內分泌，Schwann/nerve，骨髓和淋巴樣細胞?亞亞群分細胞CAF析確定了五個亞群：炎...
使用技術：10x 5’scRNA-seq+scTCR-seq+10x Visium+10x Visium HD實驗設計空間轉錄組測序：10X VISIUM 空間轉錄組：（1）、鼻竇炎患者的對照下鼻甲（CIT）2例（2）、患有鼻息肉的鼻竇炎患者的鼻息肉（NP）3例10X VISIUM HD空間轉錄組：（1）、鼻竇炎患者的對照下鼻甲（CIT）4例（2）、患有鼻息肉的鼻竇炎患者的鼻息肉（NP）6例...
近日，10x Genomics公司Sarah E. B. Taylor實驗室在《Nature Genetics》（IF：31.7）發表了一篇題為 “High-definition spatial transcriptomic profiling of immune cell populations in colorectal cancer” 的文章。該研究對來自5位結直腸癌患者的FFPE樣本...
樣本取樣及檢測技術① Xenium空間轉錄組：健康供體9名，IPF患者12名，其他PF患者14名（包括間質性肺病、過敏性肺炎等）；② Visium HD空間轉錄組：4名患者（1名健康供體，3名PF患者）；③ 單細胞RNA測序：整合已發表的人類肺單細胞數據集進行比較分析；技術路線1.空間原位測序繪制肺組織圖譜及纖維化特征利用空間原位檢測技術，研究團隊對45個遠端肺組織樣本進行了亞細胞級的空間表...
淋巴結淋巴管 “大變身”：亞群重組為轉移鋪路通過單細胞軌跡分析和免疫染色，清晰呈現淋巴管亞群的重塑 —— 展示 LEC 從正常亞群向 CD200+HEY1+ LEC 的分化軌跡，直觀對比轉移性與非轉移性淋巴結中 CD200 + 淋巴管的分布差異，甚至捕捉到癌細胞在 CD200 + 淋巴管內的定位，為 “亞群重組促進轉移” 提供直接可視化證據。從臨床樣本到體外實驗層層驗證 MGP 的作用 ——...
來自加利福尼亞大學的Ananda W. Goldrath團隊在Nature發表Tissue-resident memory CD8 T cell diversity is spatiotemporally imprinted研究。利用空間轉錄組技術結合計算分析，揭示了 TRM 細胞分化的細胞互作模式。通過空間 CRISPR 技術，進一步探索了細胞因子調控 TRM 細胞分化的作用，為 T 細胞...
研究背景肝細胞癌(HCC)是肝癌中最常見的組織學亞型，HCC免疫微環境（TEM）與腫瘤進展和免疫治療效果密切相關。以往研究大多關注TME中不同細胞成分的作用。然而，TME的具體結構及其對免疫治療療效的影響仍然未知。近期，中國科學技術大學劉連新教授與上海交通大學葉幼瓊教授合作在Journal of Hepatology在線發表題為“Identification of a tumour immu...
空間多組學技術研究如火如荼，研究工具不斷推陳出新。一直以來，以亞細胞分辨率解析組織中RNA和蛋白質的空間分布是空間生物學領域的一個挑戰。在2022年AGBT大會上，NanoString發布了最新的單細胞/亞細胞空間多組學創新平臺 — CosMx? Spatial Molecular Imager（SMI）空間原位分子成像系統。CosMx? SMI是一個完全自動化的集成平臺， 能夠支持研究者針...
研究技術樣本收集：收集來自27名晚期cSCC患者的腫瘤樣本，時間點包括基線（治療前）、接受1劑后以及接受3-4劑PD-1/PD-L1阻斷劑后。技術平臺：使用1.7mm組織芯構建組織微陣列，采用Nanostring CosMx平臺進行單細胞分辨率空間轉錄組測序。數據分析：進行細胞類型注釋、基因集富集分析、空間聚類以識別不同的空間微環境，并分析這些微環境與治療反應的相關性。機制探索：對代表性患者...
標題：A beginner's guide to study extracellular vesicles in human bloodplasma and serum.期刊：Journal of Vesicles Extracellular發表時間：2024年1月9日摘要 血液是獲取和研究細胞外囊泡(EVs)最為常見的體液。目前血液在臨床分析中應用廣泛，而血液來源EVs的研究更加的復雜。在...
