測試調用測試設計Survival生存曲線繪制軟件環境微生物多樣性軟件轉錄組分析軟件轉錄組軟件購買重測序軟件環境微生物多樣性軟件(1)桌面軟件中藥空間代謝組學檢測中藥非靶代謝組檢測中藥活性成分鑒定中藥入血/入靶成分分析中藥組學ATAC-seqCHIP-seqHi-C測序基因調控OmicsBeanMicrobe Trakr(微生物基因組鑒定分析工具)網頁分析系統WEB分析系統澳洲血清 BovineBD科研管KAPAQIAGENThermoFisherMVE液氮罐4titude? 樣品管標記系統Hi-C建庫試劑盒及基因組組裝軟件無血清細胞凍存液Cell Freezing Medium納米流式檢測儀lexogen支原體檢測試劑盒儀器試劑耗材數據庫開發數據中心TCGA生存數據包功能醫學報告系統開發PlantArray植物生理組平臺特色服務單細胞測序空間轉錄組測序空間代謝組DSP空間蛋白質組FFPE石蠟包埋組織單細胞轉錄組解決方案:10×Flex空間多組學類器官葉綠體、線粒體基因組測序染色體級別基因組組裝Hi-C建庫基因芯片一代測序動植物基因組de novo測序細菌基因組測序真菌基因組測序病毒基因組測序簡化基因組遺傳圖譜測序簡化基因組GWAS測序基因組重測序表觀組基因分型外顯子捕獲目標區域捕獲簡化基因組遺傳圖譜性狀定位掃描圖DNA中5-hmC圖譜測定全基因組甲基化測序真菌基因組掃描圖測序epiGBS-簡化甲基化BSA混池測序基因組SSR開發基因組(DNA)UMI-RNAseq轉錄組測序真核有參轉錄組測序真核無參轉錄組測序原核鏈特異性轉錄組測序全轉錄組測序circRNA測序Lnc RNA測序Small RNA測序circRNA芯片表達譜芯片m6A甲基化測序互作轉錄組測序降解組測序UMI-RNAseqSLAM-seq測序(RNA代謝測序)轉錄組(RNA)三代全長擴增子Meta-Barcoding(eDNA)技術研究微生物多樣性二代測序宏基因組測序宏基因組Binning分析宏基因組抗性基因測序HiC-Meta宏基因組宏轉錄組差異表達測序宏病毒組測序環境DNAHiFi-Meta宏基因組腸道菌群臨床檢測基于腸道菌群檢測和移植的腸道微生態學科建設宏基因組元素循環測序三代宏基因組宏基因組免疫球蛋白測序(Mig-seq)腸道宏基因組絕對定量醫學宏病毒組測序微生物組蛋白組代謝組抗體芯片Raybiotech芯片蛋白芯片蛋白芯片中藥代謝組ENGINE-生物標志物檢測服務ENGINE-抗體特異性服務4D蛋白質組Raybiotech芯片OLINK精準蛋白質組學解決方案常規定量蛋白質組蛋白質組定性分析靶向蛋白質組學修飾蛋白質組學非靶向代謝組學靶向代謝組學脂質組學新一代代謝組學 NGM ProLenioBio無細胞蛋白表達系統ALAMAR超靈敏蛋白組學及蛋白標志物轉化平臺超高深度血液蛋白質組蛋白和代謝組GC-MS全代謝組LC-MS全代謝組靶向代謝組脂質組學代謝組學反向色譜柱原理的DNA/RNA提取技術分子生物學CRISPR基因編輯細胞定制細胞株構建iPS構建CRISPR/Cas9DNA甲基化修飾細胞FAQ基因編輯切片圖像掃描組織芯片免疫組化微量基因組建庫專家病理切片數字存檔多色免疫熒光組織透明化技術服務病理形態學數據陪護擴增子時序分析基因突變體克隆動物中心小動物疾病模型構建和檢測服務基因編輯小鼠動物實驗支原體污染檢測服務細胞系遺傳背景鑒定細胞系鑒定外泌體全轉錄組測序外泌體分離與鑒定PBA單外泌體鄰近編碼技術PBA單外泌體蛋白質組學分析服務PBA單外泌體蛋白組樣本指南PBA外泌體免疫相關文獻外泌體專題甲基化APOBEC偶聯甲基化測序ACE-seq焦磷酸測序cfDNA甲基化測序DNA甲基化測序850K甲基化芯片935K甲基化芯片全基因組甲基化測序(WGBS)簡化基因組甲基化測序 (RRBS)目標區域甲基化測序 (Targeted Bisulfite Sequencing)甲基化DNA免疫沉淀測序 (MeDIP-seq)氧化-重亞硫酸鹽測序 (oxBS-seq)TET-重亞硫酸鹽測序(TAB-seq)5hmC-Seal,超高靈敏度的羥甲基化檢測羥甲基化免疫共沉淀測序 (hMeDIP-seq)DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)甲基化專題RNA修飾研究專題免疫印跡(Western-blot)技術服務定量Western檢測Simoa單分子免疫分析qPCRCNVSNPPGM測序PCR array數字PCR精準檢測ATAC-SeqChIP-SeqRIP-Seq基因調控Ribo-seq核糖體印跡測序技術Active Ribo-seq活躍翻譯組測序技術翻譯組數據分析數據庫構建數據價值提升10x官方發布樣本準備樣本要求樣本取材以及樣本編號技巧精簡版細胞庫組織庫動物模型轉錄組樣本準備蛋白組樣本準備代謝組樣本準備Hi-C單細胞與空間轉錄組單細胞懸液外泌體Raybiotech蛋白芯片Simoa樣本準備PBA單外泌體樣本準備ASA基因分型芯片樣本準備NULISA超靈敏蛋白組樣本準備Olink 精準蛋白組樣品準備CyTOF質譜流式樣本準備樣本準備要求表單留言板SaaS 幫助搜索Mac谷歌瀏覽器2019國自然基金查詢生信相關工具集合數據分析項目信息單提交資料分享核酸抽提產品資料轉錄組軟件教學視頻微生物多樣性軟件教學視頻Lexogen產品培訓視頻Olink精準蛋白組學專題在線學習空間轉錄組文獻PBA單外泌體蛋白組文獻NULISA微量蛋白檢測文獻OLINK精準蛋白組文獻項目進度個人中心會員登錄會員注冊購物車聯系我們公眾號手機商城公司愿景知識分享文獻展示
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細胞鑒定FAQ
  • 1.什么是細胞系鑒定?
    所謂細胞系鑒定即通過STR(短串聯重復)信息所建立細胞系的遺傳特性。一旦細胞系的遺傳特性被確立,細胞系就應該定期的檢測,以防止出現細胞系被誤認或交叉污染的情況。
    2.為什么要進行細胞系鑒定?

    由于細胞系發生交叉污染或身份誤認,可以導致實驗數據的無效和數據的誤導。NIH最近已發出公告,討論細胞系鑒定的必要性,并且越來越的的期刊要求文章發表前需提供細胞鑒定材料。

    3.如何進行細胞系鑒定?

    細胞系鑒定目前主要基于Promega GenePrint? 10系統。這種系統可以通過多重PCR結合熒光探針檢測技術,對人源7個STR位點以及1個性別決定位點進行檢測。下表為這些位點的具體的遺傳信息。

    4.什么時候需細胞系鑒定?

    當建立或獲得一個新的細胞系時 在細胞凍存之前,或細胞已連續培養2個月時
    在開始系列實驗或發表文章之前
    細胞系表現不穩定或結果與預期差別較大時
    當實驗室使用超過一種細胞系時,所有細胞系**先鑒定以排除交叉污染的可能

    5.如何提供鑒定樣本?

    每種細胞需單獨收集在1.5ml離心管中,細胞數目在0.5 x 106至1 x 106之間。細胞需要離心沉淀,并且竟可能去除上清培養基,沉淀冰凍保存。細胞樣本需保持冰凍狀態直到基因組DNA提取完畢。并且在1.5ml管壁外標明細胞數目。

    6.如何知道細胞系是否發生交叉污染了?

    如果存在細胞系之間發生交叉污染,那么在進行STR位點檢測的時候,多個位點會出現兩個以上的峰。峰高值表示該等位基因的信號強度,理論上峰值與樣本的DNA濃度有直接的關系。因此,存在交叉污染的混合細胞系中,其中一個位點中某些峰會明顯高于其他的峰,其中大峰是屬于混合細胞系中那個主要細胞系,而小峰則屬于那個次要細胞系。值得注意的是,當發生兩個或以上細胞混合的時候,檢測結果看起來非常像細胞系的“遺傳不穩定”——當一個細胞系存在亞群時,尤其是一些癌細胞系,由于遺傳不穩定的存在,在一些位點的STR特性會不同。因此經驗豐富的分子專家是非常重要的,他能夠幫助分析復雜的電泳圖譜(STR峰圖),從而判斷是否由于發生細胞系交叉污染而導致多等位基因情況。上海翼和應用生物,作為老牌的遺傳技術服務公司,十年以上基因分型經驗,可以幫你解決你的疑惑。

  • 7.如何進行數據庫比對?

    A.Cell Line Integrated Molecular Authentication (CLIMA) http://bioinformatics.istge.it/clima/
    B.American Type Culture Collection (ATCC)
    https://www.atcc.org/CulturesandProducts/CellBiology/STRProfileDatabase/tabid/174/Default.asx
    C.Japanese Collection of Research Bioresource (JCRB) http://cellbank.nibio.go.jp/cellbank_e.html
    D.German Collection of Microorganisms and Cell Cultures (DSMZ) http://www.dsmz.de/human_and_animal_cell_lines/main.php?contentleft_id=101

    8.如何判斷細胞系是否正確?

    收到細胞系鑒定結果以及STR信息,可以自行和參考數據庫進行比對。如果細胞樣本的每個STR位點和參考細胞STR位點都能重合匹配,即說明該細胞系正確,反之則說明你的細胞系可能被錯誤標記,交叉污染或發生遺傳不穩定。一般說來,匹配度≥80%即可認為該細胞系正確,匹配度<80%則說明該細胞系的來源需要被懷疑。。
    如果細胞系被鑒定出發生交叉污染或錯誤標記,則需要拿更早代數的細胞進行鑒定,從而找到問題的起源或者直接從可靠的機構購買一株新的細胞系。

    9.如果細胞系沒有在數據庫中比對出結果怎么辦?

    如果已知數據庫中沒有找到你的細胞信息,你可以用自己的細胞遺傳信息建立自己的遺傳特性,以便后期進行自己細胞庫的比對。

    10.細胞系交叉污染或錯誤鑒定對研究是否有影響?

    答案是肯定的。使用錯誤的細胞系或者是被污染的細胞系做研究,只會造成時間,金錢和精力的損失,以及造成實驗結果的不一致和不可重復。因此如果用被污染或錯誤的細胞系做研究,在發表文章或做進一步研究時極有可能需要用正確的細胞再重復實驗。