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當(dāng)前位置
葉綠體、線粒體基因組測序
產(chǎn)品介紹: 在高等生物細(xì)胞內(nèi)除了細(xì)胞核遺傳外,細(xì)胞質(zhì)遺傳也是重要的研究方向。細(xì)胞質(zhì)中主要的遺傳物質(zhì)的載體是線粒體和葉綠體。利用高通量測序技術(shù)對動(dòng)植物線粒體基因組及植物葉綠體基因組進(jìn)行測序組裝,突破傳統(tǒng)mt/cpDNA分離提純的實(shí)驗(yàn)壁壘,可直接利用組織總DNA獲得線粒體/葉綠體基因組,對序列信息進(jìn)行深入解析,通過比較基因組分析獲得物種分類、系統(tǒng)進(jìn)化、地理譜系遺傳等信息。
云生物自主研發(fā)的Enrichment富集技術(shù),可降低核DNA污染,將總DNA中靶細(xì)胞器基因組比例提升。專業(yè)生物信息團(tuán)隊(duì),提供人工基因注釋矯正,滿足NCBI數(shù)據(jù)庫上傳要求,高質(zhì)量結(jié)果交付,助力高水平研究。
技術(shù)流程:
技術(shù)優(yōu)勢: 1. 業(yè)內(nèi)**的mtDNA&cpDNA富集抽提服務(wù):自主研發(fā)的細(xì)胞器基因組富集提取技術(shù),高效實(shí)現(xiàn)高質(zhì)量細(xì)胞器基因組富集。 2. 一對一的生物信息分析,人工基因注釋矯正:告別在線注釋平臺的偏差,滿足NCBI數(shù)據(jù)庫上傳要求,高質(zhì)量結(jié)果交付,助力高水平研究。 3. 核心技術(shù)團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人均9年以上從業(yè)經(jīng)驗(yàn),項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富,提供可以個(gè)性化方案定制。 4. 已完成葉綠體&線粒體基因組項(xiàng)目數(shù)百例,96%以上樣本實(shí)現(xiàn)完成圖水平交付。 5. 配套數(shù)據(jù)庫構(gòu)建服務(wù),提升科研水準(zhǔn),助力高水平研究發(fā)表。 取樣指南: 分析示例: 葉綠體/線粒體基因組全圖
多數(shù)據(jù)庫功能注釋
基因組多態(tài)性分析
基因組線性結(jié)構(gòu)比較
IRs邊界的收縮與擴(kuò)張
比較基因組共線性分析
泛基因組共有/特有基因統(tǒng)計(jì)
系統(tǒng)進(jìn)化樹
葉綠體與線粒體片段交流分析
SSR分類統(tǒng)計(jì)
項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)(近期部分客戶文章): 1. Comparative chloroplast genomics of the genus Taxodium. BMC Genomics(IF=3.501), 2020. 2. Complete Chloroplast Genomes of Three Medicinal Alpinia Species: Genome Organization, Comparative Analyses and Phylogenetic Relationships in Family Zingiberaceae. Plants (IF=2.632), 2020. 3. Mitochondrial variation in small brown planthoppers linked to multiple traits and likely reflecting a complex evolutionary trajectory.Molecular Ecology (IF=5.855), 2019. 4. Candidate Gene Selection for Cytoplasmic Male Sterility in Pepper (Capsicum annuum L.) through Whole Mitochondrial Genome Sequencing. International journal of Molecular Sciences (IF=3.678), 2019. 5. The Chloroplast Genome of Carya illinoinensis: Genome Structure, Adaptive Evolution, and Phylogenetic Analysis. Forests (IF=2.116), 2020. 6. The complete mitochondrial genome of Calyptogena marissinica (Heterodonta: Veneroida: Vesicomyidae): Insight into the deep-sea adaptive evolution of vesicomyids.PLoS One (IF=2.776), 2019. |