ATAC-Seq介紹

ATAC-seq （ Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）是使用高通量測序對 Tn5 轉座酶可接近的核染色質區域進行測序分析的一種研究技術；該技術由美國斯坦福大學的研究人員開發，2013 年首次發表在 Nature Methods（Buenrostro et al., 2013）。通過轉座酶對特定時空下開放的核染色質區域進行切割，獲得在該時空下基因組中所有活躍轉錄的調控序列。

應用領域

1. ATAC-seq 技術可以進行樣本之間差異的染色質開放位點的比較，通常并不單獨使用。作為檢測表觀遺傳-染色質開放狀態現象的方式，與樣本基因表達譜緊密相連，從靶標基因的表觀狀態關聯到表達水平，具有強大的數據挖掘作用。
2. 通過關聯基因組、外顯子，染色質免疫共沉淀（組蛋白修飾或轉錄因子結合）測序信息，形成：表觀調控-基因組-基因表達的完整調控鏈。

技術優勢

時間短：ATAC-seq實驗過程短，從實驗到分析最快可達2周
低細胞量需求：適合對細胞量少、難以收集的樣品進行研究
覆蓋度高：可以檢測出全基因組范圍內的開放染色質區域，獲得調控序列信息

實驗流程