微生物是一群以分解代謝為主的生物類群，其生物活性十分豐富。16S rDNA基因測序已經成為當前解析原核微生物群落組成及其分布的重要手段。既往研究中，受限于NGS的讀長，物種鑒定存在很多不確定性。伴隨著三代測序技術的發展，長度長測序技術越來越成為組學研究的主流。Pacbio平臺3-5kb的平均讀長可以輕而易舉地覆蓋16s rDNA的9個高變區域，獲得的序列更長，信息量也更多！16s rDNA全長測序因此成為多樣性研究的新熱點技術。

基于三代PacBio高通量技術對微生物16S rDNA（真菌ITS、真核生物18S rRNA）全長序列進行測序，物種能夠鑒定到“種”水平，同時對樣品中的優勢物種、稀有物種以及一些未知的物種進行檢測，獲得樣品中的微生物群落組成以及它們之間的相對豐度。探討微生物多樣性對于研究微生物與環境的關系、環境治理和微生物資源的利用有著重要的理論和現實意義。此外，還推出個性化分析服務，如：篩選微生態系統中的關鍵菌種、微生物群落變化的動態監測、微生物群落共生網絡關系等多項個性化分析服務，為您的科研成果錦上添花。

1、基于三代測序，在同一分類水平下，也可以實現更多的物種分類，更是在種水平物種鑒定中實現了大幅提升，這一點就很大程度滿足了微生物學研究者的迫切需求。

圖 16s V4區與全長分類鑒定結果比較

圖 16s不同V區與全長未分類序列占比比較

圖 16s不同V區與全長未分類序列進化樹比較

2、基于三代技術開展16s全長擴增子研究，有更多的序列得到了明確的物種劃分，尤其是針對樣本中含量低微的物種，分類鑒定的效果更好。

圖 樣本中微量物種的分類識別情況和偏好性16s二代和三代比較

3、由于二代測序建庫過程中有PCR擴增的步驟，難以避免由于擴增偏好性造成的物種豐度檢測的偏差，可能造成某些特定微生物類群含量的檢測偏差，這就難以實現對樣本中微生物群落分布的真實還原。而三代測序由于不需要PCR的過程，就很大程度上降低了結果的偏差。

圖 16s V4區與全長對物種偏好性比較

4、通過聚類OTU，并與模擬物種庫進行比較，V1-V9區研究實現了對樣本的更真實還原，物種的識別和定量是最接近模擬物種庫原貌的，這一點說明了基于三代平臺的16s全長測序在保真效果上的巨大優勢。

圖 16s不同V區與全長與模擬物種庫進行比較

5、利用三代16s全長擴增子測序技術可以清晰的獲得菌株在16s全長范圍內的單核苷酸變異信息。利用這樣的信息，可以更好地對菌株實現區分，物種可實現“種”水平分類，結果更加準確。

PacBio測序（擴增子全長測序）：